A diversão de dirigi-lo vinha associada a um interior mais confortável e surgia em 2006 o Power Retractable Hard Top, com teto rígido retrátil

O interior melhorava bastante, com aspecto cada vez mais requintado — a simplicidade do Miata original era passado. O volante de três raios tinha apliques imitando alumínio escovado e atrás dele os mostradores traziam iluminação em vermelho. Uma faixa de acabamento em preto brilhante dava o toque de requinte ao painel. Suas dimensões eram de 3,99 m de comprimento, 1,72 m de largura, 1,25 m de altura e 2,33 m de entre-eixos. O peso aumentava para 1.095 kg.

A suspensão abandonava o conceito de braços duplos na traseira em favor do multibraço. Tecnologias impensáveis para os roadsters tradicionais, como controles de tração e estabilidade, chegavam ao MX-5. Nos EUA havia um novo motor de 2,0 litros e 16 válvulas, similar ao Ford Duratec (que é na verdade um projeto Mazda), com 174 cv, 19 m.kgf e caixa manual de cinco ou seis marchas. Opção era o câmbio automático de seis marchas com "borboletas" para mudanças manuais no volante. Na Europa o 2,0 entregava 163 cv e 19,2 m.kgf com seis marchas de série, mas havia um novo 1,8 de 126 cv e 17 m.kgf com cinco marchas.

Essa geração recebeu uma série especial Limited, que trazia rodas especiais com partes cromadas e várias opções de revestimento da capota, em cores como azul e verde, e do interior. Teve 3.500 unidades produzidas. A moda do teto rígido retrátil chegou ao MX-5 em julho de 2006. Com nomes diferentes dependendo do mercado (Roadster Coupe na Europa, Roadster Power Retractable Hard Top no Japão e Power Retractable Hard Top nos EUA), tinha o teto dividido em três partes móveis que se recolhiam em 12 segundos. O peso era 36 kg maior que a versão com capota de lona, mas o conforto compensava.

Em 2008 aparecia outra série especial com vários refinamentos e rodas de 17 pol. O novo padrão de estilo da Mazda chegou ao MX-5 na versão reestilizada do Salão de Paris daquele ano. Com novo estilo de grade e faróis, estava em consonância com os modelos mais recentes da casa japonesa. Por dentro havia alterações sutis, mas o motor passava a fornecer 169 cv e 19,3 m.kgf para as versões de câmbio manual e a faixa de corte de rotação subia 500 rpm. Suspensão e câmbio recebiam fino ajuste e, pela primeira vez, a caixa automática estava disponível para os europeus.

Com mais de 735 mil unidades vendidas (em nada menos que 53 cores, das quais 20 foram aplicadas apenas a edições especiais), não é exagero dizer que o MX-5 ou Miata fez ressurgir um segmento até então esquecido. É inegável o sucesso e o prestígio que o pequeno roadster trouxe à Mazda. Conquistou o coração dos aficionados pelo estilo e o prazer de dirigir que só eram encontrados em esportivos maiores e mais caros.